北厍镇位于吴江市东南部，距吴江城区25千米。东与芦墟的汾湖湾、高新村交界；南临汾湖、太浦河；西连黎里的华莺、大联村和八坼的联盟村；北依三白荡、元鹤荡以及金家坝的梅石、银杏村。

北厍镇位于北纬31°02′48″～31°03′37″，东经120°46′18″～120°47′30″。2003年，全镇土地总面积49.13平方千米，其中镇区面积2.13平方千米。